Daedalus, Origami de ADN automatizado.

El portal de noticias del MIT publica un reportaje de Helen Knight que informa sobre los avances en algoritmos para construir estructuras de ADN. Estas estructuras  de ADN,  de escala nanoscópica, se construyen en la práctica actual a partir de hebras de ADN mediante un proceso manual que es laborioso y complejo y se conoce como origami de ADN.

El desarrollo de un algoritmo que puede construir las nanopartículas de  ADN automáticamente es una novedad.

El algoritmo parte de una representación geométrica en 3D de la forma final del objeto y a partir de allí decide como debe ser ensamblada la estructura.

El líder del equipo de investigación es el profesor del MIT Mark Bathe, PhD,  quien dice que su estrategia cambia el problema que habitualmente consiste en que un experto diseñe el ADN necesario para sintetizar el objeto, a uno en el cual el objeto es el punto de partida y las secuencias necesarias las determina el algoritmo.  Declara además que su esperanza es que esta automatización haga más amplia la participación de otros en el paradigma de diseño molecular.

El algoritmo recibió el nombre de DAEDALUS (DNA Origami Sequence Design Algorithm for User-defined Structures), en referencia a Dédalo de la mitología griega cuyo oficio era el de arquitecto y artesano, a quien se le atribuía el diseño de laberintos.

Ahora el equipo investiga en el desarrollo de aplicaciones para las nanopartículas de ADN construidas por el algoritmo DAEDALUS. Una de esas aplicaciones es un andamio para péptidos virales y proteínas que pueden ser usadas como vacunas.

Superficies 3D  vs las representaciones basadas en ADN de diversas nanopartículas diseñadas por el algoritmo DAEDALUS. (Imagen de Digizyme)

Preocupación por relación entre la radiación del teléfono móvil y el cáncer.

Varios medios han publicado en fecha reciente información sobre resultados de una investigación que encontró correlación entre la exposición a la radiación del teléfono móvil y el desarrollo de cáncer de cerebro y corazón. 

El estudio del Programa Nacional de Toxicología de los Estados Unidos (US National Toxicology Program, NTP) aparece publicado en un preprint de bioRxiv que se presenta como resultado parcial. 

En el artículo se describe como se diseñó un sistema de exposición de los roedores a radiofrecuencia, a las frecuencias y modulaciones que se usan en la industria de las telecomunicaciones. Se dice que la ocurrencia de dos tipos de tumores (gliomas malignos en el cerebro y schwannomas de corazón) en ratas Harlan Sprague Dawley machos se consideran de particular interés.  

Este estudio todavía debe ser sometido a revisión por pares pues es un pre-print todavía no arbitrado. Sin embargo ha levantado mucho interés por el impacto que podría tener en para la salud pública. Pueden seguirse algunos enlaces a medios que han dado cobertura noticiosa a la investigación: Revista Science AAAS, Scientific American, Revista TIME,  CBS Filadelfia,  y muchos otros.

Ley de Moore

La revista Technology Review del MIT trae un artículo escrito por Tom Simonite que titula Moore’s Law Is Dead. Now What? (La Ley de Moore está muerta. ¿Ahora qué?) donde analiza el presente y futuro de las computadoras y en general de dispositivos hechos con chips que incluyen transistores. 

Para los que no conocen la materia, la ley de Moore se debe a Gordon Moore quien en 1965 observó que los transistores, que son los elementos activos en un circuito integrado o chip, se estaban encogiendo tan rápidamente que cada año se podía duplicar el número de los que cabían en un chip. Luego en 1975 ajustó su relación a la duplicación en dos años en vez de uno.  

Esa predicción de Moore se ha mantenido y al crecer el número de transistores en un chip la industria ha encontrado que hacer con ellos. Intel ha sido una de las compañías que ha hecho presión en el ritmo de crecimiento, pero ahora ha decidido incrementar el tiempo entre generaciones y ha sugerido que los transistores de silicio solo pueden seguir reduciendo el tamaño por otros cinco años. 

Una de las áreas que se vería afectada por la falta de crecimiento en número de transistores por chip es la de los centros de datos pues la demanda seguirá creciendo.  El artículo sugiere que los arquitectos de la computación tendrán que trabajar en mejorar el diseño de los chips para obtener mayor poder de cómputo y también para hacer chips que se especialicen en acelerar algoritmos cruciales.  Se van a requerir chips afinados para el álgebra relacionada con técnicas poderosas de aprendizaje de máquina en lo cual ya está trabajando la compañía de tarjetas gráficas Nvidia, entre otras. 

Muchos retos por delante para la industria y las ciencias de la computación.

Patrón de chip Skylake (Dominio Público @Intel)